Kokoro to Kokoro traz um retrato íntimo e sensível sobre a amizade duradoura entre duas mulheres: a avó paterna falecida do diretor nipo-brasileiro André Hayato Saito e uma amiga do Japão. Esse amor platônico e transcendental é consumado por um pacto: as duas combinaram de se reencontrar após a morte onde os botos cor-de-rosa se reúnem numa região fluvial da Amazônia. A relação entre Shigeru e Takae celebra a vida e narra a morte, relatando a conexão não só entre as duas, mas culturas diferentes. O documentário faz parte da trilogia de curtas nos quais o cineasta André Hayato Saito investiga sua ancestralidade japonesa.